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CRISPR/Cas12a(anciennement appeléCpf1) appartenant àClasse 2 Type V système crisprEst un mécanisme immunitaire adaptatif des bactéries et des archées pour identifier et couper l'ADN viral ou plasmidique envahissant. Par rapport à cas9, son mode de fonctionnement lui confère des avantages significatifs dans l'édition de gènes, la détection moléculaire et la régulation multigénique.

| paramètre | CRISPR/Cas12a | CRISPR et Cas9 |
|---|---|---|
| Taille des protéines | 1200 - 1300 acides aminés (plus petits) | 1000 - 1600 acides aminés |
| Dépendance ARN | Seulement nécessairecrARN(sans tracrrna) | NécessairecrARN + tracrARNOu sgrna chimérique |
| Traitement crrna | Activité RNase autonome (capacité de traitement intégrée) | Hôtes dépendants RNase III et tracrrna |
| Type de fin de coupe | 黏性末端(5' 突出) | Extrémité plate |
| Séquence de reconnaissance PAM | 5'-TTTN/TTTV-3'(riche en t) | 5'-NGG-3'(riche en g) |
| Domaine Nucléase | UniqueDomaine ruvc | Double domaine hnh + ruvc |
| Activité de coupe trans | Oui (l'ADN ssdna peut être coupé de manière non spécifique) | Rien |
NotePour:
VReprésente A / C / G (non t), comme 5 '- ttta / TTTC / tttg - 3'.
黏性末端Il est plus facile de déclencher la réparation de recombinaison homologue (HDR) pour améliorer l'efficacité de l'édition de précision.
Efficacité de l'édition multigéniquePour:
Un seul réseau de crrna peut cibler plusieurs gènes simultanément sans avoir à construire des tracrrna à plusieurs reprises et convient à la régulation de voies complexes.
Adaptation génomique enrichie atPour:
L'efficacité de l'édition des génomes riches en at (p. ex., plantes, parasites) est significativement plus élevée que celle de cas9.
Faible risque de déracinementPour:
Dépend strictement de l'activation de PAM, et l'activité de trans - clivage peut être désactivée, avec un taux de désactivation du génome entier inférieur à celui de cas9.
Facilité de livraisonPour:
Les protéines sont plus petites et plus faciles à emballer dans des vecteurs viraux tels que AAV, ce qui convient à la thérapie génique in vivo.
| Direction d'application | CAS | Avantages incarnés |
|---|---|---|
| Knockout multigénique | Modification synchrone de 3 gènes résistants à la sécheresse dans le maïs, efficacité d'édition > 60% | Crrna Array simplifie la conception |
| Insertion génétique de précision | HDR amélioré avec des extrémités visqueuses pour la réparation du sous - gène de la coagulation Fix - yin d'origine humaine | Réparation haute fidélité |
| Diagnostic moléculaire | Développement de la détection des acides nucléiques en combinaison avec l'activité de trans - Cutting (crispr - Detect) | Haute sensibilité, aucune amplification PCR requise |
| Recherche antivirale | Modification du gène du récepteur du virus bmnpv chez les vers à soie, 40% plus efficace que cas9 | Coupe efficace de la zone d'enrichissement at |
| Optimisation des vecteurs de thérapie génique | Cas12b (la variante la plus petite) est 50% moins ciblée que cas9 et convient à la clinique | Livraison haute sécurité |